Page History
Navitabs | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||
Indledning
Dette dokument beskriver installation og konfiguration af Antigentest indlæseren.
Antigentest indlæseren består af komponenten antigentestindlaeser.war, der skal konfigureres og deployes på en applikationsserver.
Projektet bygges med Maven og kræver Java 8 samt en MariaDB-installation for at kunne afvikle unit-tests.
Udover normalt tilgængelige Maven dependencies, afhænger projektet også af interne artefakter. Hvis disse artefakter ikke er udgivet (released) i den påkrævede version i NSP's Nexus repository, skal man selv udtjekke og bygge dem fra NSP's Subversion i den pågældende version. Artefakternes forskellige versioner vil være tilgængelige under et Subversion-tag. Disse artefakter er:
- stamdataindlaeser (Maven identifier:dk.nsi.sdm.stamdataindlaeser:stamdataindlaeser)
For at bygge disse interne artefakter, henvises der til artefakternes dokumentation.
Alle filer der refereres til ligger sammen med projektets kildekode i NSP's Subversion. Referencer til stier er relative med udgangspunkt i projektets rodmappe.
Byggevejledning
For at bygge projektet og dets deployables (war-filen) uden at køre unit-tests og integrationstests, anvendes følgende Maven kommando:
mvn clean install -DskipTests
Projektets deployables ender i target-mappen under de respektive moduler.
Afvikling af unit-tests
Unit-testene i projektet kan afvikles med følgende Maven-kommando:
mvn clean test
Alternativt kan også samtidigt bygge projektet ved at anvende Maven-kommandoen:
mvn clean install
Når unittests afvikles startes en database og SFTP server op vha. TestContainers. Relevante databaseobjekter oprettes automatisk i den forbindelse.
Afvikling af integrationstests
Se testvejledningen.
Krav til miljø
Komponenten er tilpasset at kunne indgå i det aktuelt gældende CI-miljø på NSP. Det tager aktuelt udgangspunkt i version 1 af NSP's platform Docker image.
Krav til database
Servicen er testet mod MariaDB version 10.4, som bliver brugt på NSP platformen.
Krav til hardware
Der stilles ikke nogle særlige minimumskrav til hardware, men man skal forvente at bruge high-end hardware (både cpu, ram, netkort og diske) for at kunne opfylde de gældende svartidskrav på NSP.
Oprettelse af databaser og tabeller
Herunder beskrives servicens tilgang til database samt oprettelse af tabeller.
Tilgang til database
Antigentest indlæseren kræver en enkelt database til at gemme forskellige stamdata under indlæsningen.
Servicen konfigureres med 1 datasource, som tilgår databaserne vha. root brugeren.
Oprettelse af database og tabeller
Datamodellen styres vha. de SQL-scripts, der findes under src/main/resources/db/migration.
Scriptene er udformet til at blive kørt med databasemigreringsværktøjet Flyway. Scriptene er designet til at kunne blive brugt i både test- og produktions-miljø.
Ved initial installation af servicen vil Flyway håndtere at køre scriptene i den korrekte rækkefølge:
Deployment
Komponenten deployes vha. NSP's platform Docker image og konfigurationsfiler mountes i containeren som angivet i projektets Compose-filer.
Alle konfigurerbare properties bør gennemgås inden idriftsættelse, men standardværdierne er tiltænkt anvendelse i produktion medmindre andet er angivet.
Konfiguration
Herunder beskrives de properties der findes i antigentestindlaeser-komponentens konfigurationsfiler.
yder.properties
Property | Beskrivelse | Default |
---|
Property
Beskrivelse
Default
datasource. |
jndi | Angiver navnet på den datasource der er konfigureret på Wildfly'en og som anvendes til stamdata. | java:jboss/datasources/ |
datasource.RO.jndi
java:jboss/datasources/readonly
keep_backup_days
Antal dage hvor backup af leverede filer gemmes
batch_problem_cutoff_hours
fixed_ydernr
905429
send_ssi_alert
send_ssi_alert_protocol
ssi_batch_camelUrl
ssi_skabelon_camelUrl
ssi_statistik_camelUrl
synlab_rekv_camelUrl
synlab_kvit_camelUrl
stralfors_brev_camelUrl
stralfors_kvit_camelUrl
...
antigentest | ||
batchSize | Data persisteres i databasen i batches og størrelsen på disse angives i denne property. | 100 |
batchTimeout | Hvis der ikke er flere data at persistere, og det igangværende batch derfor ikke kan nå batchSize, angiver denne tiden i millisekunder der ventes på yderligere data før et batch anses for at være komplet. | 500 |
inputDeviceUrl | Camel udtryk for hentning af data | *) |
monitorDeviceUrl | Camel udtryk for monitorering af data kilden | **) |
fetch.cron | Cron job der angiver hvornår data hentes Default værdien angiver hentning af data hver dag kl 01:00 | 0+0+1+?+*+* |
Camel udtryk er meget lange så defaultværdierne står her:
...
De angivne passwords herunder er udelukkende til illustration og de er ikke gyldige passwords
*)
sftp:ssi@proevebestillingsftp:22/ssi/batch?password=pass&readLock=rename&antInclude=*.xlsx&delete=true&disconnect=true&stepwise=false&initialDelay=5s&delay=5s&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts
**)
sftp:ssi@proevebestillingsftp:22/ssi/skabelon?password=pass&readLock=rename&antInclude=*.docx&noop=true&disconnect=true&stepwise=false&initialDelay=5s&delay=5s&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts
***)
sftp:ssi@proevebestillingsftp:22/ssi/statistik?password=pass&tempFileName=${file:name.noext}.tmp&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts
****)
sftp:synlab@proevebestillingsftp:22/synlab?password=pass&tempFileName=${file:name.noext}.tmp&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts
*****)
sftp:synlab@proevebestillingsftp:22/synlab?password=pass&readLock=rename&antInclude=*.kvit&delete=true&disconnect=true&stepwise=false&initialDelay=5s&delay=5s&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts
******)
sftp:stralfors@proevebestillingsftp:22/stralfors?password=pass&tempFileName=${file:name.noext}.tmp&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts
*******)
https:covid-19-diagnostics.jrc.ec.europa.eu/devices/export/csv?manufacturer=&text_name=&marking=Yes&method=&rapid_diag=1&target_type=6&search_method=AND
**)
https://covid-19-diagnostics.jrc.ec.europa.eu/devicessftp:stralfors@proevebestillingsftp:22/stralfors?password=pass&readLock=rename&antInclude=*.csv&delete=true&disconnect=true&stepwise=false&initialDelay=5s&delay=5s&knownHostsFile=/pack/wildfly8/modules/dk/nsi/sdm/proevebestilling/known_hosts