Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Dato

Ansvarlig

Beskrivelse

22/11-2021Mikael Jørgensen

Initiel version

22/02-2022Mikael Jørgensen

Tilrettet jf.

Jira
serverNSI JIRA
columnIdsissuekey,summary,issuetype,created,updated,duedate,assignee,reporter,priority,status,resolution
columnskey,summary,type,created,updated,due,assignee,reporter,priority,status,resolution
serverIde64c3bc3-001c-3439-bc53-f7a235a8cd61
keySDS-5401




Adgang, brug og snitflader

...

Teknisk navnantigentestregister
OpdateringsfrekvensDagligt
Kildehttps://covid-19-diagnostics.jrc.ec.europa.eu/devicesNSP Proxy - URL
Versioner1 (ny reference implementering)

...

Antigentest indlæseren henter data ved at kalde den beskrevne HTTP grænseflade med et antal søgekriterier.

Den URL der kaldes er:

https://covid-19-diagnostics.jrc.ec.europa.eu/devices/export/csv?manufacturer=&text_name=&marking=Yes&method=&rapid_diag=1&target_type=6&search_method=AND

URL'en fortæller at der hentes data

  • på csv (tegnsepareret) format (csv)
  • enheder der er CE godkendte (marking=Yes)
  • enheder der anvendes til hurtigtest (rapid_diag=1)

Hvis et andet udtræk ønskes, kan konfigurations-propertien inputDeviceUrl ændres til at levere de ønskede data.

URL til NSP Proxy i produktion

URL'en henter et fast datasæt fra NSP Proxy.

URL'en styres via konfigurations-propertien inputDeviceUrl.De mulige værdier kan afprøves på https://covid-19-diagnostics.jrc.ec.europa.eu/devices/

Input hentes fra den angivne URL og data mappes til tilsvarende felter i databasen

Håndtering af boolske værdier

Nogle af felterne i de modtagne CSV data repræsenterer boolske værdier.

Værdier der tilhører

("1", "yes", "y", "true")

opfattes som true og alle andre opfattes som false.

Hvis et felt indeholder en tydeligvis ikke boolsk værdi, vil den derfor opfattes som false.

Hentning af data

Antigentest indlæseren vil hente data med den frekvens der er angivet i konfigurations propertien fetch.cron.

...

Efter behov kan hentning af data aktiveres via statussiden ved at kalde URL'en http://<host>:<port>/antigentestindlaeser/status?FetchData=Start hvor <host> og <port> peger på den aktuelle installation.

Datatyper - oversigt

Navn

Beskrivelse

antigentestStamdata for et antigentest udstyr

Datatyper - detaljer

Datatype: antigentest
FeltnavnBeskrivelseOptionalUnik nøgleType
idDevice
Udstyrs IDNejxVarChar(16)
commercialName
display
Udstyrs navn

Display tekst

Ja
VarChar(
250
1000)
idManufacturer
Producent IDJaVarChar(16)
manufacturerName
Producent navnJaVarChar(150)
manufacturerCountry
Producent land
lang
SprogJa
VarChar(50)
manufacturerWebsite
Producent webadresse
active

Angiver om testen er aktiv

Ja
VarChar(150)
ceMarking
JainthscCommonList

Boolean
system
DatakildenJa
int
hscMutualRecognition
Jaint
formats
Ja

VarChar(
100
targets
1000)
physicalSupports
JaVarChar(2000)
version

Tidsstempel der angiver versionen

Ja
VarChar(
50
1000)
specimens
JaVarChar(2000)
pathogens
JaVarChar(3000)
validUntil
Tidsstempel der angiver slutdato for testenJa
VarChar(
lineages
JaVarChar(50)
commercialStatus
JaVarChar(50)
lastUpdated
JaVarChar(50)
idTest
JaVarChar(16)
assayCategory
JaVarChar(50)
rapidDiagnostic
Jaint
selfTest
Jaint
readerRequired
Jaint
method
JaVarChar(50)
measurement
JaVarChar(50)
subclass
JaVarChar(50)
detectionPrinciple
JaVarChar(50)
subcategory
JaVarChar(50)
timeMinutes
JaVarChar(50)
lod
JaVarChar(2000)
positiveControl
JaVarChar(50)
negativeControl
JaVarChar(50)
performanceControl
JaVarChar(2000)
calibration
JaVarChar(50)
analyticalSensitivity
JaVarChar(50)
analyticalSpecificity
JaVarChar(50)
crossreactivity
JaVarChar(2000)
fp
JaVarChar(2000)
fn
JaVarChar(2000)
precisionX
JaVarChar(2000)
accuracy
JaVarChar(2000)
reproducibility
JaVarChar(2000)
robustness
JaVarChar(50)
clinicalSensitivity
JaVarChar(2000)
clinicalSpecificity
JaVarChar(2000)
throughput
JaVarChar(2000)
typeOfAntigen
JaVarChar(
200)

DataModifiedDate

Modificeret (format: yyyy-MM-ddTHH:mm:ss+Z)Ja

Timestamp

DataValidFrom

Gyldig fra (format: yyyy-MM-ddTHH:mm:ss+Z)Nej
Timestamp

DataValidTo

Gyldig til (format: yyyy-MM-ddTHH:mm:ss+Z)Nej
Timestamp

Statusside

Statusservicen kan tilgås på URL http://<host>:<port>/antigentestindlaeser/status hvor <host> og <port> peger på den aktuelle installation.

...

  • Afhængighedsproblemer (fx. ingen forbindelse til kilden)
  • Værdier i de hentede date data overholder ikke formatet eller enkelte værdier overstiger den allokerede længde i databasen

...